三湾五谷库建庙於清咸丰元年(一八五一)，信士陈氏捐地三百坪建立庙宇，并自竹南五谷宫奉迎神驾供奉，惟初建庙宇简陋，迨民国二十四年台湾大地震，中间经过多次改建，直至六十九年农历六月十一日，恭迎神农大帝及众神像登龛镇座，并於七十三年农历十一月十二日起，隆重举行庆成圆满福醮法会大典，此盛况成为三湾乡境近百年来大事之一，乡民对五谷神农大帝的虔诚，可见一斑。